Etudiant brillant, Martin Hirsch commence par suivre les cours de l'Ecole Normale supérieure et prépare un DEA en neurobiologie, avant de se réorienter vers l'administration en intégrant l'ENA.
A l'issue de sa formation, il occupe pendant deux ans le poste de conseiller juridique à la Caisse Nationale d'Assurance Maladie des travailleurs salariés, puis assure cette même fonction au ministère de la santé entre 1992 et 1993.
Il prend ensuite la direction de la Pharmacie centrale des Hôpitaux de Paris.
En 1995, il est nommé président de l'Union centrale des communautés Emmaüs.
En 1997 il devient directeur de cabinet de Bernard Kouchner et fait ses premiers pas dans la sphère politique. Il est aussi conseiller au cabinet de Martine Aubry.
En 1999 il endosse les responsabilités de premier Directeur général de l'AFSSA.
En 2006 il fonde l'Agence Nouvelle des solidarités actives, association de lutte contre la pauvreté.
Le 18 mai 2007 c'est l'aspect politique de sa carrière qui prend le dessus, il est nommé Haut commissaire aux solidarités actives contre les pauvretés.

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